Jason Bourne is op de rand van de dood gewond en lijdt aan geheugenverlies. Hij wordt op zee gered door een visser.Met niets anders dan een Zwitsers bankrekeningnummer begint hij zijn leven te reconstrueren, maar ontdekt dat veel mensen die hij tegenkomt hem dood willen.Bourne realiseert zich echter dat hij over de gevechts- en mentale vaardigheden beschikt van een spion van wereldklasse, maar voor wie werkt hij?