The Bourne Trilogy boxset bevat drie films die het verhaal volgen van Jason Bourne een man met geheugenverlies die zijn verleden probeert te achterhalen terwijl hij wordt opgejaagd door inlichtingendiensten Disc 1 The Bourne Identity Een man wordt op zee gevonden zonder herinnering aan zijn identiteit en moet ontdekken wie hij is terwijl hij wordt achtervolgd door huurmoordenaars Terwijl hij aanwijzingen volgt ontdekt hij dat hij deel uitmaakte van een geheim overheidsprogramma dat hem trainde tot een hoogopgeleide operative Met hulp van een vrouw genaamd Marie reist hij door Europa om de waarheid te achterhalen terwijl hij uit handen blijft van zijn achtervolgers Uiteindelijk confronteert hij zijn verleden en kiest hij ervoor om met het programma te breken Disc 2 The Bourne Supremacy Terwijl hij ondergedoken leeft wordt Jason Bourne vals beschuldigd van een mislukte CIA operatie waardoor hij opnieuw in de wereld van spionage terechtkomt Hij probeert zijn naam te zuiveren terwijl hij wordt opgejaagd door agenten en huurmoordenaars Naarmate hij dieper graaft ontdekt hij verbanden met zijn eerdere missies en de mensen die hem hebben gemanipuleerd Het verhaal leidt tot een confrontatie waarin Bourne rekenschap zoekt en zijn zoektocht naar zijn identiteit voortzet Disc 3 The Bourne Ultimatum Jason Bourne zet zijn zoektocht voort naar de waarheid over zijn verleden en het programma dat hem heeft gecreeerd Terwijl journalisten en inlichtingendiensten dichterbij komen volgt hij een spoor van aanwijzingen door meerdere landen dat leidt naar de oorsprong van het programma genaamd Treadstone Voortdurend opgejaagd door overheidsinstanties gebruikt hij zijn vaardigheden om voor te blijven en het programma te onthullen Uiteindelijk ontdekt hij hoe hij werd gerekruteerd en begint hij de controle over zijn leven terug te nemen